Некоторые основные причины возникновения налоговых споров с налоговыми органами:

• Различия в толковании налогового законодательства. 2 Налогоплательщики и налоговые органы могут иметь разную позицию в отношении порядка применения в конкретной ситуации тех или иных положений законодательства. 2
• Недостаточная подготовка налоговой отчётности. 2 Ошибки в расчётах или неправильное заполнение передаваемых в налоговую инспекцию отчётов и других документов могут привести к внеплановым проверкам. 2
• Незаконное применение льгот и вычетов. 2 Часто компании стремятся снизить налоговое бремя и подогнать финансовую деятельность под требования законодательства, определяющего порядок предоставления налоговых льгот и вычетов. 2 Однако такие действия быстро вскрываются при проверке со стороны налоговой инспекции. 2
• Нарушение порядка проведения проверки со стороны ФНС. 2 В процессе проведения налоговых проверок возникают ситуации, когда должностные лица выходят за пределы предоставленных им полномочий, в том числе нарушают сроки проведения проверки, запрашивают документы, выходящие за предмет проверки, оказывают определённое давление на работников проверяемого лица. 2
• Неправильное начисление налогов. 4 Налогоплательщики могут считать, что налоговые органы неправильно рассчитали сумму налога, которую им нужно уплатить, например, из-за неверного применения ставок или налоговых льгот. 4