Несколько возможных причин, по которым премии могут не попадать в 6-НДФЛ:

• Неправильный код премии. 1 В расчёте 6-НДФЛ код премии не указывают, так как в форме не предусмотрены отдельные поля по каждому виду доходов. 1 Код нужно указать в справке о доходах, которая является приложением к 6-НДФЛ. 1 Производственные премии имеют код 2002, непроизводственные за счёт прибыли — 2003. 1
• Премия выплачивается вместе с зарплатой. 45 Если это ежемесячная премия, то для целей НДФЛ её не нужно отдельно кодировать, так как она отражается с кодом 2000 вместе с зарплатой. 5 Если же премии выдаются в межрасчётный период, то датой фактического получения дохода будет уже дата выплаты премии, и в налоговом регистре её нужно маркировать отдельным кодом 2002. 5

Для правильного отражения премий в 6-НДФЛ рекомендуется обратиться к специалисту.