Система управления государственными программами влияет на развитие отраслей экономики следующим образом:

• Конкретизирует усилия для комплексного и системного решения среднесрочных и долгосрочных проблем экономической и социальной политики страны. 3
• Обеспечивает прозрачность и обоснованность процесса выбора целей, которые необходимо достигнуть в различные временные периоды, и путей достижения результатов. 3
• Позволяет финансировать работы, направленные на создание и выпуск новой инновационной продукции, на обновление промышленности на новой технологической основе. 3
• Нацеливает финансовые и нефинансовые инструменты на поддержание точек роста отраслей. 5

Кроме того, система управления госпрограммами разделяет их на отраслевые, направленные на развитие конкретных отраслей и сфер экономики, и комплексные, предусматривающие решение межотраслевых задач и задач территориального развития страны. 1 В отраслевых госпрограммах собираются все мероприятия и расходы в конкретной отрасли, что обеспечивает большую прозрачность бюджета и деятельности государственных органов. 1