Система пеней положительно влияет на эффективность налоговой дисциплины, так как она:

• Компенсирует потери государственной казны в результате несвоевременной уплаты налога. 3 К сумме не внесённого в срок налога законодатель вправе добавить дополнительный платёж — пени. 3
• Обеспечивает исполнение обязанностей налогоплательщиком. 3 Пеня выступает частью налогового обязательства и обеспечивает его исполнение. 3

Однако наличие налоговой задолженности из-за пеней может отрицательно влиять на работу хозяйствующих субъектов: 2

• Повышать расходы. 2 Начисление пеней на сумму неуплаченных налогов приводит к потере денежных средств. 2
• Формировать отрицательный имидж. 2 В доступном информационном пространстве поставщики, заказчики и другие заинтересованные лица могут проверить добросовестность партнёра, в том числе и наличие у него налоговой задолженности. 2

Таким образом, система пеней способствует балансу интересов общества и государства, обеспечивая как возмещение ущерба государству, так и наказание для налогоплательщика за несвоевременную уплату налога. 23