Система учёта бюджетных обязательств в казначействе работает следующим образом: 14

1. Получатель средств федерального бюджета или орган казначейства формируют сведения о бюджетном обязательстве. 14 Если сведения не содержат государственную тайну, они делаются в форме электронного документа в информационных системах Министерства финансов РФ и Федерального казначейства. 14 Подписываются усиленной квалифицированной электронной подписью руководителя или иного уполномоченного лица. 14
2. Сведения, содержащие государственную тайну, формируются и направляются в казначейство на бумажном носителе и при наличии технической возможности — на съёмном машинном носителе информации. 13
3. Орган казначейства проверяет сведения. 23 В случае положительного результата проверки присваивает учётный номер бюджетному обязательству и в день постановки на учёт направляет получателю средств федерального бюджета извещение о бюджетном обязательстве. 23
4. В бюджетные обязательства, поставленные на учёт до начала текущего финансового года, исполнение которых осуществляется в текущем финансовом году, орган казначейства вносит изменения в первый рабочий день текущего финансового года. 5

Для формирования сведений используется единая государственная интегрированная информационная система управления общественными финансами «Электронный бюджет». 1