Процесс проведения комплексной налоговой проверки крупного предприятия включает несколько этапов: 2

1. Включение в план компаний, которых будут проверять. 2 Налоговая отбирает предприятия на основании камеральной проверки и по общедоступным критериям риска. 2 Если у налоговой есть вопросы к бизнесу, она включает его в план проверок. 2
2. Разработка программы. 2 Сотрудники налоговой определяют, что нужно проверить для подтверждения своих подозрений. 2 Например, если у работников компании маленькая зарплата, могут проверить правильность уплаты НДФЛ и страховых взносов. 2 А если компания постоянно снимается с места учёта, скорее всего, будут проверять по всем налогам. 2
3. Назначение выездной проверки. 2 Руководитель налоговой инспекции или его заместитель оформляет решение о проведении выездной проверки. 2 В нём должно быть указано название компании, предмет контроля — какие налоги, сборы и страховые взносы будут проверять, период мероприятия и фамилии инспекторов, которые будут участвовать в нём. 2
4. Проведение проверки. 2 Налоговая может: 2

• изучать документы: счета-фактуры, акты, договоры и прочие бумаги, которые относятся к бизнесу; 2
• изымать документы, если в них есть подтверждение налоговых нарушений и проверяющие подозревают, что компания попытается избавиться от бумаг; 2
• осматривать помещения и территорию; 2
• опрашивать свидетелей — например, сотрудников или партнёров; 2
• проводить инвентаризацию, чтобы проверить данные, которые бизнес отражал в декларациях; 2
• привлекать сторонних специалистов, если нужна экспертная оценка. 2

1. Оформление справки о проведении проверки. 2 С этого момента проверка считается законченной. 5 Дальше в течение двух месяцев в ИФНС должны составить акт по итогам ревизии. 5 В документе нужно отразить найденные нарушения или указать на их отсутствие. 5 В течение пяти дней инспектор должен вручить акт проверяемому лицу. 5
2. Вынесение итогового решения. 2 Если были выявлены нарушения законодательства, то налоговый орган, анализируя имеющиеся сведения, выносит одно из возможных решений. 3

Когда речь идёт о крупных компаниях, то проверку осуществляет только тот налоговый орган, который ставил субъект на учёт. 3