Взаимодействие между Федеральным казначейством и другими государственными учреждениями организовано следующим образом:

• Взаимодействие с Министерством финансов Российской Федерации. 1 Казначейство составляет и представляет в Минфин России оперативную информацию и отчётность об исполнении федерального бюджета, а также доклады и предложения о совершенствовании методического обеспечения деятельности органов государственного контроля. 1 Кроме того, казначейство обобщает практику применения законодательства в сфере своей деятельности и вносит в Минфин России предложения по его совершенствованию. 1
• Взаимодействие с Банком России. 1 Казначейство открывает в Банке России и кредитных организациях счета по учёту средств федерального бюджета и иных средств. 1 Банк России, в свою очередь, осуществляет обслуживание единого казначейского счёта и банковских счетов Федерального казначейства, а также безвозмездно оказывает ему услуги по передаче финансовых сообщений. 1
• Взаимодействие с администраторами поступлений в бюджеты, финансовыми органами и органами управления государственными внебюджетными фондами. 4 Оно осуществляется путём направления органами Федерального казначейства документов о проведённых операциях по учёту (перечислению) поступлений в бюджеты, а также получения от администраторов поступлений в бюджет документов в пределах возложенных на них бюджетных полномочий. 4