Некоторые отличия автономного учреждения от бюджетного в сфере финансового управления:

• Участие учредителя в финансировании. 1 Учредитель автономного учреждения в обязательном порядке устанавливает для него государственное (муниципальное) задание на предоставление услуг и осуществляет финансовое обеспечение исполнения задания с учётом расходов на содержание недвижимого и особо ценного движимого имущества. 1 Бюджетные учреждения полностью или частично финансируются собственником их имущества. 1
• Распределение и использование полученной из бюджета субсидии. 1 Автономное учреждение самостоятельно распределяет и использует полученную из бюджета субсидию (субвенцию) на выполнение задания учредителя, неся при этом ответственность за своевременное и полное исполнение задания, предоставление услуг соответствующего качества в рамках его исполнения и достижение установленных показателей результативности. 1
• Распоряжение доходами. 1 Автономное учреждение самостоятельно распоряжается доходами, полученными от оказания платных услуг или исполнения работ по договорам помимо исполнения задания учредителя. 1
• Открытие счетов. 13 Автономное учреждение вправе открывать счета в кредитных организациях, расходование средств автономным учреждением не контролируется органами Казначейства Российской Федерации. 1
• Привлечение заёмных средств. 1 Автономное учреждение вправе привлекать заёмные средства в рамках осуществления своей деятельности. 1