Да, если ИП зарегистрирован по месту жительства, он может вести деятельность в другом регионе, в котором есть льгота по УСН. 13

На упрощённой системе налогообложения нет ограничений по территории, на которой можно вести деятельность. 1 Предприниматель может работать в одном регионе, а отчитываться и платить налоги в другом — в ИФНС по месту регистрации в качестве ИП. 1 При этом он вправе воспользоваться пониженной ставкой налога и налоговыми каникулами того субъекта РФ, в котором стоит на учёте как предприниматель. 1

Однако ставка налога по УСН определяется не местом осуществления деятельности, а местом регистрации. 2 Поэтому даже если ИП будет вести деятельность в регионе с льготной ставкой, платить налог он обязан по ставке региона своей регистрации. 2