Системы автоматизации отдельных разделов бухгалтерского учёта ориентированы на конкретный участок учёта и направлены на решение определённых задач, например, сводного стоимостного учёта на основе бухгалтерских проводок и несложного аналитического учёта. 1

Комплексные системы рассчитаны на средние и крупные предприятия и обеспечивают полную автоматизацию учётного процесса, развёрнутую и многоуровневую аналитику, а также расширенный состав задач, включая модули других функциональных подсистем (помимо бухгалтерских в систему могут быть включены АРМ руководителя, менеджера коммерческого отдела, АРМ по учёту кадров и др.). 2

Таким образом, основное различие заключается в том, что системы автоматизации отдельных разделов фокусируются на конкретных задачах определённого участка учёта, в то время как комплексные системы охватывают весь учётный процесс в целом, включая дополнительные модули других функциональных подсистем.