Возможно, имелись в виду различия между созданием счетов на оплату и счетов-фактур в программе «1С:Управление торговлей» (1С:УТ). 13

Счёт-фактура создаётся на основании продажи. 3 Для её оформления в форме документа выбытия товара нужно выбрать опцию «Оформить счёт-фактуру». 1 При этом формируется документ «Счёт-фактура выданный». 1 Поддерживается автоматическая нумерация счетов-фактур. 1

Счёт на оплату можно создать уже после отгрузки товара. 4 Для этого, открывая журнал отгруженной продукции, нужно выбрать меню «Счёт покупателю» на основании накладной реализации или выданной счёт-фактуры. 4

Таким образом, счёты-фактуры создаются в процессе отгрузки товара, а счёты на оплату — после отгрузки.