Разные виды налоговых инспекций отличаются по функциям и структуре:

1. Межрегиональная инспекция ФНС России по централизованной обработке данных. 12 Её основная задача — автоматизация процессов контроля и надзора за соблюдением законодательства о налогах и сборах. 1 Основные функции включают ведение федеральных информационных ресурсов, обеспечение информационной поддержки деятельности ФНС России, обмен информацией в электронном виде с государственными органами и предоставление информации органам государственной власти, местного самоуправления и налогоплательщикам. 1
2. Межрегиональная инспекция ФНС России по федеральному округу. 1 Инспекции этого типа выполняют как общие функции, так и специализированные задачи в федеральных округах. 1 Среди ключевых полномочий — взаимодействие с полномочным представителем Президента РФ в федеральном округе и проведение проверок эффективности работы управлений ФНС России по субъектам РФ, включая проверку правильности исчисления, полноты и своевременности уплаты налогов. 1
3. Межрайонная инспекция по крупнейшим налогоплательщикам. 13 Она работает с крупнейшими налогоплательщиками и осуществляет контроль и надзор за соблюдением законодательства о налогах и сборах, правильностью исчисления, полнотой и своевременностью уплаты налогов, сборов и страховых взносов. 37

По структуре разные виды налоговых инспекций также отличаются:

• Территориальные инспекции ФНС (территориальные ИФНС) непосредственно работают с налогоплательщиками. 10 Они есть практически во всех городах и районах. 10 Если город крупный и разделён на районы, то в нём несколько инспекций — по одной на каждый район. 10 Если город или район небольшой, то несколько таких городов или районов могут быть объединены под началом одной межрайонной инспекции. 10
• Специализированные межрайонные инспекции контролируют какой-то один вид налогоплательщиков. 10 Например, в Москве есть межрайонные инспекции по контролю за иностранными организациями и за строительной сферой, а во многих регионах есть инспекции по контролю за крупными налогоплательщиками. 10