Разные инспекции ФНС отличаются по функциональным обязанностям в зависимости от своего уровня и специализации. 13

Межрегиональные инспекции занимаются конкретными задачами и обеспечивают отдельные направления деятельности ФНС. 1 Например, межрегиональная инспекция по централизованной обработке данных обеспечивает гражданам или компаниям доступ к сведениям из реестров и выдаёт через интернет выписки из них. 1 Другие межрегиональные инспекции курируют крупнейших налогоплательщиков страны, за каждой из них закреплены конкретные отрасли. 1 Так, в Межрегиональной инспекции ФНС №1 стоят на учёте крупнейшие налогоплательщики, отнесённые к транснациональным компаниям, а МИ ФНС №2 курирует тех, кто занимается добычей нефти и газа, производством, торговлей и переработкой нефтепродуктов. 1

Территориальные инспекции непосредственно работают с налогоплательщиками. 3 Они проводят выездные и камеральные налоговые проверки, могут вызвать на допрос, провести выемку документов и прийти в компанию с осмотром. 1 Именно территориальные органы взыскивают налоги, если их кто-то вовремя не заплатил. 1

Таким образом, функциональные обязанности разных инспекций ФНС отличаются по направленности контроля и взаимодействия с налогоплательщиками.