Возможно, имелись в виду различия между межрегиональными и территориальными налоговыми органами, в том числе в городах федерального значения.

Межрегиональные инспекции действуют на федеральном уровне и занимаются работой с определёнными категориями налогоплательщиков и их отраслевой принадлежностью. 1 Например, есть межрегиональные инспекции по федеральным округам, по крупнейшим налогоплательщикам, по централизованной обработке данных и по ценообразованию для целей налогообложения. 25

Территориальные налоговые органы непосредственно работают с налогоплательщиками. 3 Если город крупный и разделён на районы, то в нём несколько инспекций — по одной на каждый район. 3 Если город или район небольшой, то несколько таких городов или районов могут быть объединены под началом одной межрайонной инспекции. 3

Таким образом, межрегиональные инспекции отличаются тем, что их деятельность ориентирована на работу с конкретными категориями налогоплательщиков, а территориальные органы занимаются контролем в зависимости от территориальной принадлежности. 2

В городах федерального значения, как и в других субъектах РФ, есть управления Федеральной налоговой службы (УФНС), которые являются территориальными органами ФНС России и входят в единую централизованную систему налоговых органов. 15