Начисления пеней в бухгалтерском и налоговом учёте отличаются следующим образом:

• В бухгалтерском учёте пени по налогам относятся к прочим расходам и отражаются на счёте 99 или 91 в зависимости от вида налога. 14 Например, пени по налогу на прибыль и налогам, уплачиваемым в связи с применением УСН и ЕСХН, отражаются на счёте 99, а по другим налогам — на счёте 91. 4
• В налоговом учёте пени по налогам не уменьшают прибыль, так как это запрещено пунктом 2 статьи 270 НК РФ. 14

Таким образом, в бухгалтерском учёте пени отражаются как расход, а в налоговом — нет, так как не могут уменьшать прибыль. 14