Функции государственного и муниципального казначейства в финансовой системе отличаются:

• Государственное казначейство (Федеральное казначейство РФ) обеспечивает исполнение федерального бюджета, кассовое обслуживание бюджетов федерального, регионального и местного уровня, контролирует операции с финансовыми ресурсами федерального бюджета. 110 К его функциям также относятся регулирование финансовых отношений между бюджетом и государственными внебюджетными фондами, краткосрочное планирование объёмов финансовых ресурсов, консолидация и анализ сведений о состоянии государственных финансов, управление и обслуживание государственного долга РФ. 14
• Муниципальное казначейство управляет средствами местной казны и обслуживает исполнение местного бюджета. 2 В силу локальных особенностей бюджетного процесса муниципальные структуры могут использовать частные подходы к организации работы. 5

Таким образом, основное отличие заключается в том, что государственное казначейство занимается управлением финансами на федеральном уровне, а муниципальное — на уровне местного самоуправления.