Некоторые отличия финансового аудита от аудита эффективности в государственном контроле:

• Цели. 14 Финансовый аудит направлен на определение правильности ведения, полноты учёта и отчётности, законности и целевого использования государственных средств. 1 Аудит эффективности предполагает оценку эффективности деятельности министерств, ведомств, организаций по использованию ими государственных ресурсов. 4
• Объекты. 13 Объектами финансового аудита являются организации, предприятия и учреждения. 13 Аудит эффективности охватывает не только организации, но и социальные группы граждан, на деятельности или жизнеобеспечении которых отражаются результаты использования государственных ресурсов. 3
• Предмет. 3 Предметом финансового аудита являются результаты расходования бюджетных средств, отражаемые в финансовых документах и отчётности. 3 Аудит эффективности фокусируется на результатах использования государственных ресурсов по удовлетворению общественных потребностей. 3
• Подход. 2 Финансовый аудит предполагает внешний контроль за деятельностью министерств, аудит эффективности — внутренний. 2
• Акцент. 2 При финансовом аудите — на статьях расходов и исполнении бюджета, при аудите эффективности — на достижении социально-экономических результатов и общем объёме расходов. 2

При этом аудит эффективности и финансовый аудит основываются на ряде общих принципов и подходов финансового контроля. 13