Централизованные и кастодиальные депозитарии отличаются по своим функциям и деятельности:

1. Централизованный депозитарий — основное юридическое лицо, которое осуществляет полный контроль над всеми депозитариями. 1 Он является центром обработки данных по операциям с ценными бумагами и обеспечивает работу единой системы для регистраторов и других депозитариев. 24 В России роль центрального депозитария выполняет Национальный расчётный депозитарий (НРД), принадлежащий Московской бирже. 34
2. Кастодиальный депозитарий работает индивидуально с каждым клиентом. 2 Он занимается учётом, хранением ценных бумаг и содействует соблюдению прав по ценным бумагам. 5 Кроме стандартных услуг, кастодиальный депозитарий может выступать в качестве кредитора для клиента при недостаточном финансировании при заключении сделки. 1