Возможно, имелись в виду различия в периодах, за которые заполняют 6-НДФЛ за 1 квартал и за полугодие.

В расчёте за 1 квартал указывают период с 1 января по 31 марта. 35

В расчёте за полугодие — с 1 января по 30 июня. 35

Таким образом, при заполнении 6-НДФЛ за 1 квартал не включают, например, начисленную, но не выплаченную в январе–марте зарплату. 1 Такую сумму отражают в расчёте за полугодие. 1

При этом в каждом отчёте 6-НДФЛ сведения о доходах, налоговых вычетах и суммах НДФЛ указывают нарастающим итогом, то есть суммарно с начала года. 2