WebMoney отличается от традиционных банковских систем электронных платежей рядом особенностей:

• Универсальность. 2 Пользователи могут совершать переводы и платить за товары или услуги в валютах разных стран. 2
• Внутренняя валютная биржа. 3 В WebMoney можно конвертировать валюту не только автоматически по курсу у оператора системы, но и на валютной бирже, участниками которой являются анонимные клиенты WebMoney. 3
• Кредитование клиентов. 3 Чтобы воспользоваться кредитом, придётся пройти сертификацию. 3
• Взаимодействие с банковской системой. 1 WebMoney Transfer имеет собственную программу работы с российскими банками, в рамках которой банкам-участникам предоставляется право на эмиссию электронных чеков. 1
• Помощь в бухгалтерском учёте и правовая поддержка. 1 В отличие от многих подобных систем, WebMoney имеет подробные комментарии и разъяснения для пользователей — юридических лиц и индивидуальных предпринимателей. 1