Чем отличается внутренний бюджет военной организации от государственного?

Возможно, имелись в виду различия между военным и общегосударственным бюджетами. По информации из одного из источников, военный бюджет составляет часть общегосударственного, но отличается характером расходов: военный бюджет преимущественно расходный. imha.ru

При этом нормы, которые регулируют общегосударственный бюджет, не в полной мере распространяются на военный. imha.ru Для военных расходов может потребоваться отдельный закон или даже выделение военного (оборонного) бюджета из общегосударственного. www.cfin.ru

В России, например, согласно одному из положений, военные учреждения по своим расходам финансируются исключительно из федерального бюджета, если другое не предусмотрено законодательными и иными нормативными правовыми актами РФ. normativ.kontur.ru