Территориальные отделы казначейства и центральный аппарат имеют свои особенности и задачи. 13

Территориальные отделы представляют третий, локальный уровень казначейства и работают на местах в разрезе городов, районов и иных территориальных единиц. 1 Их основное назначение — исполнение федерального бюджета по доходам и расходам на конкретной территории. 5

Центральный аппарат — это первый, федеральный уровень казначейства. 1 Он включает в себя структурные подразделения: управления по основным направлениям деятельности, разделённые на отделы. 12 На управления центрального аппарата возложено обеспечение деятельности казначейства и осуществление своих полномочий и функций в соответствии с регламентом и иными локальными нормативными актами. 1

Таким образом, основное отличие в том, что территориальные отделы занимаются работой на местах, а центральный аппарат — управлением и обеспечением деятельности всей системы казначейства в целом.