Регистрация в межрегиональной инспекции и обычной налоговой службе имеет некоторые отличия.

Межрегиональные инспекции — крупные подразделения, которые входят в систему налоговых органов. 1 Они занимаются конкретными задачами и обеспечивают отдельные направления деятельности ФНС. 1 Например, МИФНС по централизованной обработке данных обеспечивает гражданам или компаниям доступ к сведениям из реестров и выдаёт через интернет выписки из них. 1 Другие межрегиональные инспекции курируют крупнейших налогоплательщиков страны, за каждой из них закреплены конкретные отрасли. 1

Обычные городские и районные налоговые инспекции занимаются взаимодействием с основной массой налогоплательщиков: физическими и юридическими лицами. 1 Они есть практически во всех городах и районах. 3

Таким образом, основное отличие заключается в том, что межрегиональные инспекции специализированы на определённых задачах и курируют определённые категории налогоплательщиков, в то время как обычные налоговые инспекции работают с основной массой налогоплательщиков.