Основное отличие налога на добычу полезных ископаемых (НДПИ) от водного налога заключается в объектах налогообложения и сферах, за которые взимаются платежи.

НДПИ — федеральный налог, который платят организации, добывающие полезные ископаемые, в том числе за пределами России. 13 Размер платежа определяется, исходя из типа добываемого сырья, его цены и условий добычи. 2

Водный налог — региональный налог за пользование водными объектами. 1 Его уплачивают организации, ИП и физические лица, которые пользуются водными ресурсами страны, например, берут воду из водоёмов, добывают с её помощью электроэнергию, затрагивают акватории. 13

Таким образом, НДПИ связан с добычей полезных ископаемых, а водный налог — с использованием водных ресурсов.