What are the main differences between airport check-in desks and airline reservation desks?

Возможно, имелись в виду различия между стойками регистрации в аэропорту и стойками бронирования авиабилетов.

Стойки регистрации в аэропорту (check-in desks) предназначены для того, чтобы пассажиры, которые не прошли регистрацию онлайн, могли получить посадочные билеты и сдать багаж. 4 Обычно такие стойки открывают за 2–4 часа до вылета рейса. 4

Стойки бронирования авиабилетов (reservation desks) связаны с оформлением билетов, при бронировании нужно указать имена и фамилии пассажиров, даты их рождения и контактные данные. 2

Таким образом, основное различие заключается в функциях: стойки регистрации в аэропорту занимаются процессом посадки на рейс, а стойки бронирования — заказом билетов.