Болотная черепаха обычно обитает в лесных, степных и лесостепных районах. 1 Встречается в различных пресных водоёмах: болотах, прудах, озёрах, плавнях, старицах, медленно текущих реках, каналах. 1 Рек с быстрым течением избегает. 1

Предпочитает равнинные водоёмы с пологими берегами, хорошо прогреваемыми мелководными участками, как заросшие растительностью, так и без неё. 1 Иногда встречается в черте посёлков и городов. 1

В РФ наиболее многочисленна в системах рек Азово-Черноморского и Каспийского бассейнов. 3

Как правило, держится вблизи водоёмов, но может и удаляться от них на небольшое расстояние. 1