Некоторые отличия неофункционализма от классического функционализма:

• Фокус внимания: классический функционализм был ориентирован на раскрытие механизмов действия и воспроизводства социальных структур, практически не проявляя интереса к историческим изменениям. 3 Неофункционализм, в отличие от функционализма, сосредоточен на непосредственном процессе интеграции между государствами. 4
• Подход к государству: функционализм использовал целостный подход, в то время как неофункционализм рассматривает государство в терминах сегментов, говорит о плюрализме и многочисленности политических субъектов, различии потребностей, предпочтений и интересов, действующих в его рамках. 7
• Роль социальных изменений: классический функционализм предполагал, что в рамках социальной системы происходит прогрессирующая дифференциация её элементов. 1 Представители неофункционализма отмечают, что эта тенденция действует неравномерно и в ряде случаев может быть обращена вспять. 1
• Источник изменений: в работах неофункционалистов в качестве одного из источников изменений в общественной жизни рассматриваются конфликты между социальными группами. 1
• Цель теории: классический функционализм стремился к созданию всеобъемлющей теории, в то время как неофункционализм предлагает более ограниченную, но при этом целостную теорию. 1
• Эмпирическая основа: в отличие от предыдущих теорий интеграции, неофункционализм попытался описать и объяснить процесс региональной интеграции на основе эмпирических данных. 4