Основные отличия между прокариотами и эукариотами с точки зрения микробиологии заключаются в следующем:

• Наличие ядра. 23 У прокариот ядро отсутствует, их ДНК не отделена от цитоплазмы. 2 У эукариот есть клеточное ядро, изолирующее генетический материал. 2

• Организация генетического материала. 4 В клетках прокариот генетический материал располагается непосредственно в цитоплазме и представлен нуклеоидом, содержащим чаще всего замкнутую в кольцо молекулу ДНК. 4 У эукариот генетический материал отделён ядерной оболочкой и заключён в ядре. 4

• Наличие органелл. 23 Для прокариот не характерно наличие мембранных органелл внутри клетки. 2 У эукариот, помимо ядра, есть эндоплазматический ретикулум, аппарат Гольджи, лизосомы и пероксисомы. 2

• Размер и форма клеток. 2 Обычно клетки эукариот в десятки раз больше прокариотических. 2 Среди клеток эукариот большее разнообразие форм, они способны динамично изменять свою форму. 2

• Способ размножения. 3 Прокариоты размножаются делением пополам (бинарным делением), эукариоты — митозом и мейозом. 3