Некоторые главные причины деградации поверхностных вод:

• Загрязнение. 12 В водоёмы попадают различные химические вещества, например токсичные тяжёлые металлы, пестициды, нефтепродукты, поверхностно-активные вещества. 24 Загрязнение может быть химическим, бактериальным, радиоактивным, механическим и тепловым. 1
• Сброс неочищенных сточных вод. 1 Наибольший вред водоёмам и водотокам причиняет выпуск в них неочищенных сточных вод — промышленных, коммунально-бытовых, коллекторно-дренажных и других. 1
• Смыв ядохимикатов ливневыми осадками. 1 С сельскохозяйственных территорий, включая животноводческие комплексы, в водоёмы смывается большое количество опасных загрязняющих веществ. 1
• Создание крупных водохранилищ. 1 Перегораживание русла водотоков плотинами опасно серьёзными негативными последствиями для большинства гидробионтов. 1
• Интенсивная эксплуатация подземных вод. 1 Интенсивная эксплуатация подземных вод в районах водозаборов и мощный водоотлив из шахт, карьеров приводит к изменению взаимосвязи поверхностных и подземных вод, значительному ухудшению речного стока, прекращению деятельности родников, ручьёв и небольших рек. 1