Экологические преимущества микробиометаллургии перед традиционными методами добычи металлов заключаются в следующем:

• Меньшее использование химических веществ. 2 Микробиометаллургия позволяет минимизировать применение вредных химических реагентов. 2
• Снижение энергопотребления. 2 Использование микроорганизмов для извлечения металлов делает процесс более устойчивым и менее затратным. 2
• Уменьшение негативных экологических последствий горнодобывающих работ. 1 Например, снижается эрозия склонов и образование шахтных отвалов. 1
• Возможность работать с низкосортными рудами. 2 Обработка таких руд традиционными методами экономически нецелесообразна, а с помощью микроорганизмов становится возможной. 2
• Возможность добывать металлы из руд глубокого залегания без ущерба для ландшафта. 1