Значимость Зейской ГЭС для защиты региона от наводнений заключается в том, что водохранилище станции имеет специальную противопаводковую ёмкость. 3

Некоторые примеры эффективности работы Зейской ГЭС в борьбе с наводнениями:

• 2007 год. 23 Максимальные притоки в водохранилище составляли 15 200 м³/сек, а максимальный сброс через сооружения ГЭС — 4700 м³/сек. 3 Это позволило предотвратить масштабное затопление населённых пунктов на Зее и Амуре. 3
• 2013 год. 23 Во время сильнейшего наводнения за весь период наблюдений водохранилище станции аккумулировало до 60% притекающей воды, чем значительно сгладило последствия стихийного бедствия. 5
• 2022 год. 5 Благодаря работе Зейской ГЭС почти весь паводковый сток в объёме 4,7 млрд тонн воды был задержан в водохранилище станции. 5 Это позволило избежать затопления населённых пунктов и объектов инфраструктуры ниже по течению. 5

Таким образом, Зейская ГЭС не только вырабатывает электроэнергию, но и обеспечивает защиту региона от катастрофических наводнений. 23