Основная задача Пограничной службы ФСБ России — защита и охрана Государственной границы Российской Федерации, её сухопутных и водных рубежей, а также морских биологических ресурсов исключительной экономической зоны РФ. 13

Некоторые другие задачи службы, согласно Федеральному закону от 04.05.2000 №55-ФЗ «О Пограничной службе Российской Федерации»: 25

• предотвращение противоправного изменения прохождения границы; 25
• обеспечение соблюдения физическими и юридическими лицами режима границы, пограничного режима и режима в пунктах пропуска; 25
• охрана внутренних морских вод, территориального моря, исключительной экономической зоны, континентального шельфа РФ и их природных ресурсов; 25
• координация деятельности федеральных органов исполнительной власти, которые занимаются защитой и охраной границы; 25
• осуществление государственного контроля в сфере охраны морских биологических ресурсов. 25

Кроме того, Пограничная служба выполняет и другие задачи, которые возложены на неё федеральными законами и международными договорами РФ. 25