Главное отличие эстуария от дельты реки заключается в их структуре:

• Эстуарий — однорукавное, воронкообразное устье реки, расширяющееся в сторону моря. 1 Образование эстуария происходит, если приносимые рекой наносы удаляются морскими течениями или приливом, и прилегающая к устью часть моря имеет значительные глубины. 1
• Дельта — устье, разделённое на несколько протоков. 1 Это низменная равнина в низовьях реки, сложенная речным аллювием и прорезанная сетью протоков. 1 Дельта имеет форму треугольника. 5

Таким образом, эстуарий — это обширный залив, образуемый рекой перед впадением в море или океан, а дельта — это разветвление русла реки перед впадением в море на множество рукавов. 2