Уникальность экосистемы Кавказского заповедника заключается в следующем:

• Разнообразные природные ландшафты. 3 Здесь преобладают холмы, горные массивы и обширные альпийские луга, а также имеются многочисленные ледники и карстовые пещеры с запутанными подземными лабиринтами. 3
• Сохранение видов, сохранившихся с ледниковых времён и даже с эпохи динозавров. 1 В заповеднике произрастает более 3600 видов растений, грибов и других живых существ. 1
• Наличие редких эндемичных растений. 1 Например, на Лагонакском нагорье встречаются колокольчик Отрана, молочай оштенский и лютик Елены. 1
• Древние болота. 1 Некоторые из них, такие как Луганское болото, имеют возраст более 8 тыс. лет, и эти древние экосистемы продолжают сохраняться благодаря уникальному климату. 1
• Субальпийское высокотравье. 1 Травы могут достигать высоты 2–4 метров, что делает эти районы похожими на гигантские, живые поля. 1
• Реликтовые виды. 1 Например, ковыль перистый, который свидетельствует о более сухих и тёплых климатических условиях прошлых эпох. 1

Эти и другие особенности флоры и фауны заповедника делают его ценнейшим объектом для научных исследований и экотуризма. 1