Разница между синэкологией и фитоценологией заключается в предметах изучения.

Синэкология (также известна как биоценология или общая экология) изучает комплексы видов в сообществах, то есть экосистемы. 5 Синэкология рассматривает процессы совместного приспособления ассоциаций различных видов растений, животных, микроорганизмов к среде их обитания. 2

Фитоценология (или геоботаника) занимается изучением растительных сообществ. 4 Это совокупность растений на относительно однородном участке земной поверхности, совместно продуцирующих органическое вещество. 5

Таким образом, синэкология охватывает более широкий объект изучения, охватывая экосистемы в целом, в то время как фитоценология фокусируется на изучении отдельных растительных сообществ.

При этом синэкология и фитоценология тесно связаны: первоначально синэкология была синонимом фитоценологии, но сейчас рассматривается как часть последней, охватывающая экологическое изучение фитоценозов. 2