В чем разница между ортодромией и фактическим маршрутом следования?

Возможно, имелись в виду различия между ортодромией и маршрутом прямого следования, а не фактическим маршрутом.

Ортодромия — это кратчайшее расстояние между двумя точками на поверхности Земли. www.tutu.ru ru.wikipedia.org В судо- и самолётовождении, где Земля принимается за шар, ортодромия представляет собой дугу большого круга. ru.wikipedia.org

Маршрут прямого следования — это прямое беспересадочное сообщение либо кратчайший маршрут с наименьшим количеством пересадок от пункта отправления до конечного пункта назначения. econom.rkomi.ru

Таким образом, разница между ортодромией и маршрутом прямого следования заключается в том, что ортодромия — это абстрактное понятие, а маршрут прямого следования — конкретный путь с определёнными характеристиками.

При этом допускается незначительное отклонение фактического маршрута от маршрута прямого следования, например, в пределах 100 километров. econom.rkomi.ru Так, если по маршруту прямого следования расстояние между двумя точками по прямой составляет 1000 км, а фактический маршрут имеет остановку, и суммарное расстояние по прямой между тремя пунктами не превышает 1100 км, то такой маршрут допустимо считать прямым. econom.rkomi.ru