В чем разница между номерами с географическим и числовым кодом?

Возможно, имелись в виду автомобильные номера, на которых есть числовой код региона и специальные знаки с другим числовым кодом.

Числовой код региона — это двух- или трёхзначное число, которое указывает на субъект Российской Федерации, в котором зарегистрировано транспортное средство. ria.ru Каждому региону России соответствует свой уникальный код. www.ixbt.com Исключение составляют номера военного автотранспорта, на которых вместо кода региона указывается цифровой код, обозначающий военный округ или вид войск. ria.ru

Номера для автомобилей дипломатических представителей содержат код региона, где номер выдан, и код страны, к которой он принадлежит. cars.avtocod.ru

Таким образом, разница между указанными типами номеров в том, что в первом случае речь идёт о кодировании принадлежности к региону, а во втором — о обозначении другого параметра транспортного средства.