Разница между курьерской и грузовой доставкой через Яндекс заключается в характере доставляемых грузов и условиях перевозки.

Курьерская доставка подходит для небольших вещей и документов весом до 10 кг. 3 Как правило, курьер работает от двери до двери и доставляет посылку не спеша, по более низкой цене. 3

Грузовая доставка предназначена для крупных грузов, вес которых может достигать 1400 кг. 3 Для перевозки используют грузовые машины грузоподъёмностью от 300 кг до 2 тонн. 1 С машиной могут быть один или два грузчика. 1

Таким образом, курьерская доставка подходит для не слишком срочных отправлений, а грузовая — для крупных грузов.