В чем разница между изогипсой и изогиптой на карте?

Возможно, имелись в виду понятия «изогипса» и «изобата».

Изогипса (горизонталь) — линия на карте, состоящая из точек с одинаковой высотой над уровнем моря или другим выбранным уровнем. ru.wikipedia.org Используется для отображения рельефа морского дна и суши на топографических, физических и гипсометрических картах. ru.wikipedia.org

Изобата — линия на карте или плане, соединяющая точки одинаковых глубин водоёма (озера, моря). geo.god-tigra.ru

Таким образом, разница между изогипсой и изобатой в том, что изогипса относится к изображению высот, а изобата — к глубинам.