Разница между дневным и ночным маршрутами общественного транспорта Санкт-Петербурга заключается в графике работы:

• Дневные маршруты работают с 5:00–6:00 до 00:00–00:30. 16 Транспорт прибывает на остановки примерно каждые 10–20 минут. 1
• Ночные маршруты дублируют линии метро и ходят с 00:00 до 06:00 (маршруты с буквами «М»). 12 Интервал движения — 30 минут. 2

Таким образом, основное различие заключается в том, что дневные маршруты работают в дневное время, а ночные — в ночное, с учётом специального графика.