Разница между депортацией и репатриацией заключается в характере процесса и его целях.
Депортация — принудительная высылка лица или целой категории лиц в другое государство или другую местность, обычно — под конвоем. kartaslov.ru {10-host} Депортация может применяться государственными органами в отношении нелегальных иммигрантов, лиц без гражданства и т. п.. spravochnick.ru
Репатриация — возвращение на родину тех лиц, которые оказались в силу различных обстоятельств на территории другого государства. bigenc.ru К ним относятся, например, военнопленные, беженцы, перемещённые лица и другие. bigenc.ru Репатриация проходит добровольно, этим она отличается от депортации — принудительной высылки в другое государство. {6-host}