Разница между автоцистерной и автофургоном-рефрижератором заключается в их назначении и конструкции.

Автоцистерна — грузовой автомобиль, где вместо кузова используется ёмкость для транспортировки жидких грузов. 2 Цистерны используются для перевозки грузов в жидком, газообразном или сыпучем виде. 2 Загрузка и выгрузка производятся с помощью специализированных систем. 2

Автофургон-рефрижератор — вид грузовых автомобилей, который отличается наличием холодильной или морозильной установки для соблюдения точного температурного режима на всё время перевозки груза. 2 Такие типы фургонов позволяют перевозить быстропортящиеся продукты, а также грузы, требующие особых климатических условий. 9

Таким образом, автоцистерны предназначены для перевозки различных грузов, а автофургоны-рефрижераторы — для перевозки грузов, требующих определённых температурных условий.