Отличие аутэкологии от синэкологии при изучении экологии видов заключается в объекте исследования:

• Аутэкология изучает взаимоотношения отдельных организмов (видов) с окружающей средой. 37 Она определяет пределы устойчивости и предпочтения вида по отношению к различным экологическим факторам, исследует действие среды на морфологию, физиологию и поведение организма. 3
• Синэкология изучает процессы совместного приспособления ассоциаций различных видов, групп (биоценозов) растений, животных, микроорганизмов к среде их обитания. 8 Она исследует, как отдельные виды и их популяции образуют сообщества, взаимодействуют между собой и влияют друг на друга, формируя целостную экосистему. 6

Таким образом, аутэкология фокусируется на изучении индивидуальных связей отдельного организма со средой, а синэкология — на взаимоотношениях популяций, экосистем и сообществ с окружающей средой. 14