Некоторые сложности, с которыми сталкивается фотограф при микросъёмке:

• Малая глубина резкости (ГРИП). 2 Порой она составляет микроны, из-за чего сфокусировать изображение бывает крайне сложно или просто невозможно. 2
• Влияние вибрации. 2 Если пол вибрирует, микросъёмка на высоких увеличениях не даст хорошего результата. 2
• Малое расстояние от объектива до матрицы. 2 Из-за этого лучи на матрицу ложатся неравномерно, что приводит к мыльным изображениям. 2
• Малая зона резкости при высоких увеличениях. 2 Например, при увеличении 40х зона резкости крайне мала, и при срабатывании затвора фокусировка сбивается. 2

Для преодоления этих сложностей рекомендуется использовать штатив и дистанционный спуск затвора, а также матрицы с электронным затвором. 12