Жёлтый суслик считается важным звеном экосистемы пустынных регионов, потому что в большинстве мест своего обитания он является основным потребителем растительности. 13 Он питается полупустынными и пустынными эфемерами, луковицами и клубнями, семенами и побегами полыней, злаков и других растений. 13 В его рационе до 30 видов растений. 1

Кроме того, от состояния популяций жёлтого суслика напрямую зависит успешность размножения и численность большинства степных хищников. 5 Зверёк входит в кормовую базу хищных птиц, многих псовых и кошачьих обитателей степи. 5

Также норы жёлтого суслика служат убежищем для многих мелких обитателей пустынь. 13