Железнодорожный транспорт считается потенциально опасным для экологии по нескольким причинам:

• Загрязнение атмосферного воздуха. 14 Выбросы отработавших газов тепловозов содержат капли воды, топливо, масло, сажу, оксиды углерода, азота, серы и другие вредные вещества. 1 Также к загрязнению приводит распыление сыпучих грузов при их погрузке, выгрузке и транспортировке. 1
• Загрязнение водных объектов. 24 Сточные воды, используемые в технологических процессах на объектах железнодорожного хозяйства, токсичны для окружающей среды. 24 Они загрязняют воду взвешенными частицами, нефтепродуктами, бактериальными загрязнениями, кислотами, щелочами, поверхностно-активными веществами. 24
• Загрязнение территорий предприятий. 24 Железнодорожные станции с локомотивными и вагонными депо являются источником образования и аккумуляции твёрдых отходов, что приводит к захламлению больших территорий в придорожной полосе отвода или за её пределами. 24
• Шум и вибрация при движении поездов. 24 Основные источники шума — движущиеся поезда, путевые машины, производственное оборудование. 24 Движение поездов вблизи объектов жилищной инфраструктуры негативно сказывается на акустическом климате населённых пунктов и жилых помещений. 24
• Разрушение среды обитания. 5 Строительство и обслуживание железнодорожных линий требуют значительных изменений в землепользовании, включая вырубку лесов и других естественных мест обитания. 5 Эти изменения могут оказать пагубное воздействие на местные экосистемы, приводя к утрате биоразнообразия и нарушению природных процессов. 5