Земная поверхность в районе Байкала опускается из-за расширения земной коры, которое происходит из-за расхождения Евразийской и Амурской плит. 2

Эти плиты расходятся с обеих сторон со скоростью около 3–4 мм в год, образуя континентальный разлом с северо-востока на юго-запад. 2 В результате образуется глубокая рифтовая долина, которая заполняется водой. 2

Кроме того, есть предположения, что проседание впадины Байкала связано с образованием вакуумных очагов вследствие излияния базальтов на поверхность в четвертичный период. 35