Землетрясения на Санторини происходят чаще, чем в других регионах Греции, из-за движения тектонических плит. 1 Африканская плита поддвигается под Эгейскую, за счёт этого движения образовалась Эгейская вулканическая дуга, на которой находится Санторини. 1
Также сейсмическая активность связана с разломами между Санторини и соседним островом Аморгос. 3