Заповедник «Чёрные земли» считается уникальной природной территорией России по нескольким причинам:

• Ландшафт. 3 На территории заповедника смыкаются три зоны — степная, полупустынная и пустынная. 3
• Наличие редких видов растений. 23 Особенную ценность представляют тюльпаны Шренка, занесённые в Красную книгу России. 3
• Обитание сайгаков. 35 Эти животные из-за деятельности человека оказались на грани исчезновения, и в заповеднике осуществляется их охрана и восстановление популяции. 5
• Наличие водно-болотного угодья международного значения — озера Маныч-Гудило. 13 Здесь находятся гнездовья и зимовки многих редких видов водоплавающих и околоводных птиц. 1

Заповедник получил официальный биосферный статус ЮНЕСКО 3 декабря 1993 года. 14