Западный и Восточный Саяны имеют разные климатические условия из-за положения в центре материка, значительной приподнятости над уровнем моря и сложности орографии. 3

В Западном Саяне погода более мягкая, климат континентальный. 1 В среднем температура в этой области зимой от -17 до -29 градусов, летом от +12 до +16. 1

В Восточном Саяне континентальность климата растёт с запада на восток. 3 Зима в высокогорном поясе суровая и продолжительная, преобладает сухая ясная погода. 3 Средняя годовая температура воздуха на западных склонах Восточного Саяна около -3,8 °С, в центральной части — 5,4 °С, а близ самых высоких вершин может снижаться до -10 °С. 3